연말정산 실수, 5월 종합소득세 신고로 되돌리는 법
못 받은 공제는 추가 환급, 잘못 받은 공제는 지금 정정. 6월 1일 마감.
한 줄 결론 — 올해 1~2월 연말정산에서 빠뜨린 공제는 5월 종합소득세 신고로 추가 환급 받고, 잘못 더 받은 공제는 지금 자진 정정하면 가산세가 줄어듭니다. 마감은 6월 1일.
연말정산은 회사가 대신 해주는 약식 절차다 보니 빠뜨리는 공제가 많습니다. 국세청도 매년 5월 종합소득세 신고 기간을 연말정산 보정 창구로 활용하라고 안내합니다. 올해 핵심은 4가지입니다.
1. 5월 종합소득세 신고가 “연말정산 2차전”인 이유
근로소득자는 보통 5월 신고와 무관하지만, 다음에 해당하면 반드시 5월에 다시 신고해야 합니다.
| 케이스 | 어떻게 해야 |
|---|---|
| 공제를 못 받은 게 있다 | 경정청구 or 5월 종소세 신고로 추가 환급 |
| 공제를 더 받은 게 있다 | 5월에 자진 수정신고 (가산세 50% 감면) |
| 부양가족 공제 오류 안내문 받음 | 즉시 정정 신고 (올해 처음 개별 안내) |
| 여러 회사 다녔거나 다른 소득 있음 | 합산 신고 의무 |
→ 신고기간: 2026.5.1 ~ 6.1 (5월 31일이 일요일이라 6월 1일까지)
2. ① 못 받은 공제 — 추가 환급 받는 법
회사에 자료를 늦게 내거나 본인이 몰라서 빠뜨린 공제. 대표 케이스:
- 의료비 — 안경·콘택트렌즈비, 산후조리원비(200만원 한도), 휠체어·보청기 등
- 교육비 — 본인 대학원, 자녀 학원비(취학 전), 장애인 특수교육비
- 기부금 — 종교단체·고향사랑기부금·정치자금기부금
- 월세 세액공제 — 연소득 8천만원 이하·무주택 세대주, 한도 1천만원
- 연금저축·IRP 추가 납입 — 연 900만원까지 16.5% 세액공제
→ 홈택스 → 종합소득세 신고 → 모두채움/단순경비율 신고 메뉴에서 누락분 추가.
3. ② 더 받은 공제 — 지금 정정하면 가산세 50% 감면
가장 흔한 실수 3가지:
| 실수 | 흔한 사례 |
|---|---|
| 부양가족 소득 초과 | 부모님이 사업소득·근로소득 100만원 초과인데 인적공제 받음 |
| 부양가족 중복 공제 | 형제·자매가 같은 부모를 양쪽에서 공제 |
| 이혼·별거 배우자 공제 | 양도일 기준 세대 분리됐는데 그대로 공제 |
올해부터 부양가족 공제 오류는 국세청이 근로자에게 개별 안내문을 발송합니다. 안내문 받았으면 무시하지 말고 5월 안에 자진 수정신고 하세요. 6월 1일 이후 적발되면 무신고 가산세 20% + 납부지연 가산세 일 0.022% 가 붙습니다.
4. ③ 2개 회사 다녔거나 다른 소득 있는 경우 — 합산 신고 의무
연말정산을 한 회사에서만 했다면 반드시 5월에 합산 신고 해야 합니다.
- 1
6월 A 회사 → 712월 B 회사 이직 (B 에서 합산 정산 안 했으면) - 직장 + 프리랜서(3.3% 원천징수) 소득
- 직장 + 임대소득·이자배당소득 2천만원 초과
- 직장 + 주식 양도소득(국내 상장주식 외)
→ 합산하면 세율 구간이 올라가 추가 납부가 일반적이지만, 신고 안 하면 가산세가 더 큽니다.
5. 행동 체크리스트
마감 전 본인이 확인할 5가지:
- 연말정산 원천징수영수증 다시 보기 (회사 또는 홈택스 → My홈택스)
- 국세청 안내문(카카오톡·우편) 왔는지 확인 — 부양가족 공제 오류 안내
- 빠뜨린 공제 영수증 모아두기 (의료비·교육비·기부금)
- 다른 소득 있었는지 1년치 거래 점검 (프리랜서 3.3% 원천징수 포함)
- 홈택스 모두채움 서비스 활용 — 국세청이 미리 채워둔 자료 확인 후 보정
출처
- 정책뉴스 (2026.5.15) “연말정산 공제 실수, 종합소득세 신고로 해결하세요!” (
korea.kr/news/policyNewsView.do?newsId=148964416) - 국세청 종합소득세 신고 안내 (
nts.go.kr→ 신고납부 → 종합소득세) - 홈택스 모두채움 서비스 (
hometax.go.kr) - 소득세법 70조 (종합소득과세표준 확정신고), 81조의11 (가산세)
면책 — 이 글은 일반 정보 제공입니다. 본인 케이스가 사업소득 비중이 크거나 부동산 임대·금융소득 종합과세 대상이라면 세무사 상담 후 신고하세요. 신고 마감은 2026년 6월 1일이며, 본 글은 작성일(2026-05-18) 기준입니다.